疫情调查只要大规模排查才干告知咱们全民感染的实在数据

只要大规模排查，才干告知咱们全民感染的实在数据，并预算无症状感染率。

撰文 | 史隽

4月17日 周五

MA累计确诊 34402例

自1月底国内疫情爆发以来，就看着微信群里各种流言漫天飞。有一段时间和朋友说笑，学生物的人最近日子过得累，白日上班，晚上还要在各个微信群帮着驳斥流言。

日记里提到过的西雅图弗雷德·哈钦森癌症研讨中心 (Fred Hutchinson Cancer Research Center) 的病毒基因学专家Trevor Bedford也不能免俗，上周日连发18条推文就为了驳斥流言。

这条流言是：加州2019年秋天到2020年头的流感其实是COVID-19，所以加州现在有集体免疫，疫情没有其他州严峻。

在国内也能够正常的看到不少文章介绍这个“理论”。

Trevor以为，这种猜想和数据不契合。

他参加的Seattle flu project （西雅图流感方案）搜集了西雅图区域有急性呼吸道感染的人的鼻拭子样本。这些人中一部分有流感样疾病，如果是新冠病毒感染，也会由于症状契合条件被采样。

最近，他们检测了这些搜集的样本里是不是有新冠病毒。

在一月份搜集的3600个样本里边0个是新冠病毒。在二月份搜集的3308个样本里边，最早的新冠样本在2月21日被收集到，之后总共有10个样本是新冠测验阳性。这个故事我在从前一篇日记里边特别讲过 (见《117疫情调查：新冠无症状感染的要挟 | 史隽·Ⅲ》)。

此外，2019年10月到2020年2月的样本里边有各式各样的病毒，包含流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、间质肺病毒和一般的季节性冠状病毒 (包含4种：229E，NL63，OC43和HKU1) 。

一般的季节性冠状病毒引起的伤风约占伤风的30％，在分子测定法中很容易与新冠病毒区分隔，没有混杂的或许性。

因此能够推论，2019年10月至2020年1月的西雅图流感并非是新冠病毒盛行形成的。考虑到西雅图地点的华盛顿州和加州之间的严密游览联络， 新冠病毒不行能在加州广泛撒播，却不传达到华盛顿州。

但是，由于有无症状和轻症状感染者的存在，没有大规模的血清学测抗体的数据，很难精确的估量COVID-19患者的总数。Trevor猜想，现在确诊的病例是实践总感染人数的5% -10%，因此美国大约有2% -3%的人感染过新冠病毒。

但是，美国CDC最新计算出的R0值是5.7，这就从另一方面代表着需求大于

的人感染往后有抗体才干到达集体免疫。美国离集体免疫的方针还差很远。

加州的疫情没那么严峻，是由于防控作业做得比较到位，而不是由于集体免疫。Trevor Bedford作为作者之一的两篇预印本文章就比较了北加州和西雅图的病毒传达的不同之处。经过对许多COVID-19患者带着的病毒测序，研讨人员发现，北加州的新冠病毒有多个输入源。而西雅图只要一个输入源，便是那位从武汉省亲回西雅图的Amazon的程序员，4周里默默地传达了整个社区，直到当地疫情爆发。

Trevor Bedford的两篇文章：

Cryptic transmission of SARS-CoV-2 in Washington State

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.02.20051417v1

A Genomic Survey of SARS-CoV-2 Reveals Multiple Introductions into Northern California without a Predominant Lineage

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.27.20044925v1

至于怎样预算实践的新冠病毒感染者的总数，Trevor在4月7日的9条推文中讲过。

感染病毒今后大约在第6天人会发生抗体，即便康复今后，抗体依然能够在体内存在好几个月 (新冠病毒究竟能够存在多久的详细数据还没有，许多猜想是6-12个月) 。由于有无症状或许轻症状感染者的存在，要知道人群中究竟有多少人从前感染过新冠病毒，经典的检测的新方法便是测血液里能够结合新冠病毒的特异抗体。

相似的“血清阳性率”也曾用于前期的一些盛行症研讨。例如猪流感 (swine flu) 盛行后一年，抗体检测发现全世界约35％的人感染过这个病毒（https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0020358）。

而Zika病毒在巴西东北部大盛行期间约感染了当地60％的人口 。(https://mbio.asm.org/content/8/6/e01390-17.short)

有一个研讨依据欧洲各国感染和逝世总数，估测各国新冠病毒实践感染者占总人口的份额在1％至15％。

到2020年3月28日，模型预算的欧洲各国实践感染过新冠病毒的人数百分比。（https://imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-13-europe-npi-impact/）

在美国，最近加州有两个研讨团队做了两个小规模的抗体测验。

第一个社区测验是在加州北部的Santa Clara County (圣塔克拉拉县) 进行的，许多科技公司的总部都设在这儿。这个测验招募了社区里没有被确诊过的3,300位居民，用的一家生物技术公司Premier Biotech供给的试剂盒，发现被测验者中有2.5％至4.2％的抗体检测是阳性。这个数据再次证明北加州离集体免疫还差的很远。

圣塔克拉拉县的总人口是200万，用这个数据计算，或许感染过新冠病毒的人数在48,000至81,000之间。而在抽样的4月4日至5日，该县的官方确诊人数大约只要1,000人。这在某种程度上预示着圣塔克拉拉县的感染过新冠病毒的人数是官方确诊数字的50到80倍。

但是有几点提示我们留意：

1）这个排查的采样量还不是很大。

2）圣塔克拉拉县的成果并不能推行到美国一切的区域。

3）这个实验是在网络上招募志愿者的，志愿者不能算是整个社区居民的典型代表，由于社区里并不是一切人都会上网重视这类广告。

随后还需求进一步剖析，才干知道有多少抗体检测阳性的人由于无症状，因此从不清楚自己曾感染过病毒。

南加州大学 (University of Southern California) 的另一个团队正在加州南部的洛杉矶区域进行相似的抗体检测。

而美国CDC也在进行大规模的抗体测验，包含三个排查：

第一个是在疫情严峻的区域检查没有被确诊过的人；第二个是全国的排查；第三个是医护人员的排查。（见今日的头条文章）

期望很快能看到这些测验的成果，然后能知道全民感染的实在数据，而且预算无症状感染率。